剛剛一到秦國的時候，荊軻就帶着價值千金的禮物，厚贈秦王寵幸的臣子中庶子蒙嘉。
蒙嘉替荊軻先在秦王面前說：“燕王確實因大王的威嚴震懾得心驚膽顫，不敢出動軍隊抗拒大王的將士，情願全國上下做秦國的臣子，比照其他諸侯國排列其中，納稅盡如同直屬郡縣職分，使得以奉守先王的宗廟。因爲慌恐畏懼不敢親自前來陳述。謹此砍下樊於期的首級並獻上燕國督亢地區的地圖，裝匣密封。燕王還在朝廷上舉行了拜送儀式，派出使臣把這種情況稟明大王，敬請大王指示。”
秦王聽到這個消息，非常高興，就穿上了禮服，安排了外交上極爲隆重的九賓儀式，在咸陽宮召見燕國的使者。
荊軻捧着樊於期的首級，秦舞陽捧着地圖匣子，按照正、副使的次序前進，走到殿前臺階下秦舞陽臉色突變，害怕得發抖，大臣們都感到奇怪。
荊軻回頭朝秦舞陽笑笑，上前謝罪說：“北方藩屬蠻夷之地的粗野人，沒有見過天子，所以心驚膽顫。希望大王稍微寬容他，讓他能夠在大王面前完成使命。”
秦王對荊軻說：“遞上舞陽拿的地圖。”荊軻取過地圖獻上，秦王展開地圖，圖卷展到盡頭，匕首露出來。
荊軻趁機左手抓住秦王的衣袖，右手拿匕首直刺。未近身，秦王大驚，自己抽身跳起，衣袖掙斷。
慌忙抽劍，劍長不方便拔，於是抓住劍鞘。一時驚慌急迫，劍又套得很緊，所以不能立刻拔出。
荊軻追趕秦王，秦王繞柱奔跑。大臣們嚇得發呆，突然發生意外事變，大家都失去常態。
而秦國的法律規定，殿上侍從大臣不允許攜帶任何兵器；各位侍衛武官也只能拿着武器都依序守衛在殿外，沒有君王的命令不準進殿。
正當危急時刻，來不及傳喚下邊的侍衛官兵，因此荊軻追趕秦王，倉促之間，大臣們驚慌急迫，沒有用來攻擊荊軻的武器，只能赤手空拳和荊軻搏擊。
這時，侍從醫官夏無且用他所捧的藥袋投擊荊軻。正當秦王圍着柱子跑，倉猝慌急，不知如何是好的時候。
侍從們喊道：“大王，把劍推到背後！”秦王把劍推到背後，才拔出寶劍攻擊荊軻，砍斷他的左腿。
荊軻倒下，就舉起他的匕首直接投刺秦王，沒有擊中，卻擊中了銅柱。秦王接連攻擊荊軻，荊軻被擊傷八處。
荊軻自知大事不能成功了，就倚在柱子上大笑，張開兩腿像簸箕一樣坐在地上。
他大罵道：“大事之所以沒能成功，是因爲我想活捉你，迫使你訂立歸還諸侯們土地的契約回報太子。”
這時，侍衛們終於衝上前來殺死了荊軻，而秦王目眩良久。
關於歷史名人們對荊軻這個人物的評價和敘述：
魯句踐：嗟乎，惜哉其不講於刺劍之術也！甚矣吾不知人也！曩者吾叱之，彼乃以我爲非人也！
司馬遷：世言荊軻，其稱太子丹之命，‘天雨粟，馬生角’也，太過。又言荊軻傷秦王，皆非也。始公孫季功、董生與夏無且遊，具知其事，爲餘道之如是。自曹沫至荊軻五人，此其義或成或不成，然其立意較然，明也。不欺其志，名垂後世，豈妄也哉！
桓寬：荊軻懷數年之謀而事不就者，尺八匕首不足恃也。荊軻提匕首入不測之強秦，秦王惶恐失守備，衛者皆懼。
阮瑀：燕丹善勇士，荊軻爲上賓。圖盡擢匕首，長驅西入秦。素車駕白馬，相送易水津。漸離擊築歌，悲聲感路人。舉坐同諮嗟，嘆氣若青雲。
左思：荊軻飲燕市，酒酣氣益震。哀歌和漸離，謂若傍無人。雖無壯士節，與世亦殊倫。高眄邈四海，豪右何足陳。貴者雖自貴，視之若埃塵。賤者雖自賤，重之若千鈞。
陶淵明：燕丹善養士，志在報強贏。招集百夫良，歲暮得荊卿。君子死知己，提劍出燕京；素驟鳴廣陌，慷慨送我行。雄髮指危冠，猛氣充長纓。飲餞易水上，四座列羣英。漸離擊悲築，宋意唱高聲。蕭蕭哀風逝，淡淡寒波生。商音更流涕，羽奏壯士驚。心知去不歸，且有後世名。登車何時顧，飛蓋入秦庭。凌厲越萬里，逶迤過千城。圖窮事自至，豪主正怔營。惜哉劍術疏，奇功遂不成。其人雖己沒，千載有餘情。
駱賓王：此地別燕丹，壯士發衝冠。昔時人已沒，今日水猶寒。
王昌齡：握中銅匕首，紛銼楚山鐵。義士頻報仇，殺人不曾缺。可悲燕丹事，終被狼虎滅。一舉無兩全，荊軻遂爲血。誠知匹夫勇，何取萬人傑。無道吞諸侯，坐見九州裂。
司馬貞：刎頸申冤，操袖行事。暴秦奪魄，懦夫增氣。
柳宗元：燕秦不兩立，太子已爲虞。千金奉短計，匕首荊卿趨。窮年徇所欲，兵勢且見屠。微言激幽憤，怒目辭燕都。朔風動易水，揮爵前長驅。函首致宿怨，獻田開版圖。炯然耀電光，掌握罔正夫。造端何其銳，臨事竟趑趄。長虹吐白日，倉卒反受誅。按劍赫憑怒，風雷助號呼。慈父斷子首，狂走無容軀。夷城芟七族，臺觀皆焚污。始期憂患弭，卒動災禍樞。秦皇本詐力，事與桓公殊。奈何效曹子，實謂勇且愚。世傳故多謬，太史徵無且。
賈島：荊卿重虛死，節烈書前史。我嘆方寸心，誰論一時事。至今易水橋，寒風兮蕭蕭。易水流得盡，荊卿名不消。
周曇：反刃相酬是匹夫，安知突騎駕羣胡。有心爲報懷權略，可在於期與地圖。
張耒：燕丹計盡問田生，易水悲歌壯士行。嗟爾有心雖苦拙，區區兩死一無成。
司馬光：荊軻懷其豢養之私，不顧七族，欲以尺八匕首強燕而弱秦，不亦愚乎！故揚子論之，以要離爲蛛蝥之靡，聶政爲壯士之靡，荊軻爲刺客之靡，皆不可謂之義。又曰：“荊軻，君子盜諸！”善哉！
蘇軾：荊軻不足說，田子老可驚。燕趙多奇士，惜哉亦虛名！